Bermula daripada Bahagian Warisan di bawah Kementerian Kebudayaan, Kesenian dan Warisan (ringkasnya KeKKWa) dan dinaikkan taraf sebagai Jabatan pada 1 Mac 2006. Bertanggungjawab memelihara dan mengekalkan warisan negara seperti yang termaktub di dalam Akta Warisan Kebangsaan 2005.

Fungsi utama Jabatan Warisan Negara adalah :

• Menguatkuasakan peruntukan-peruntukan di bawah Akta Warisan Kebangsaan 2005
• Mendaftarkan warisan negara ke dalam Daftar Warisan dan Daftar Warisan Kebangsaan
• Memelihara dan memulihara warisan negara
• Menjalankan penyelidikan dan pembangunan yang berkaitan warisan
• Mendokumentasi dan menerbitkan hasil kajian serta bahan-bahan rujukan berkaitan warisan
• Merancang, melaksanakan dan menyelaras aktiviti-aktiviti berkaitan warisan
• Mengadakan jaringan kerjasama dengan agensi-agensi dari dalam dan luar negara berkaitan warisan.